实验结果这么难重复,怎样才能提高重复性呢?
实验结果这么难重复,怎样才能提高重复性呢?
刚开始做实验的时候,有一次发现一篇文章所用的细胞,处理药物和我现在的课题一模一样。那么我想用文章中的处理时间及浓度是不是可以做出来同样的结果?当时已经很晚了,看我还没走,一个前辈问我怎么还不回去。我说我正在重复一篇文章中的实验,这时她意味深长的说了一句话:“重复别人的实验?有时候你连自己做过的实验可能都重复不出来!当时我听后不以为然,心想:怎么可能连自己的实验都重复不出来?那肯定是自己的实验水平有问题呗。工作之后作为技术支持常接听客户咨询电话,有客户会电话进来表示实验结果无法重复:即使用同样的样本、同样的抗体,昨天可以做出来了,今天却没有条带。有时候是抗体批次问题,换了个批次实验就无法重复了。不仅我们普通实验者,一些学术权威们也有这样的困惑:耶鲁大学某著名的病理学家曾用抗体开发了一个黑色素瘤治疗的诊断试剂。但花费了大量的时间和金钱后,却发现新的抗体无法重复之前的结果,原来这个抗体特异性存在问题,只能被迫停止了这个项目。因此近几年来,很多学者都纷纷认为应该重视起抗体的问题,同时也要求抗体行业进行自我约束。
为什么实验结果很难重复呢?主要有5个方面的原因:1、参考文献;2、生产商;3、经销商;4、搜索引擎;5、同行审阅。下面让我们具体来看下这5个方面以及如何解决这几方面带来的困扰。
1、参考文献:是我们选择抗体的主要方式。当我们选择抗体的时候,最常用的方法是听取同行的推荐或者查阅参考文献,看看别人用了什么得到了满意的实验结果。但是通常会遇到2个问题:当你用搜索引擎去搜寻抗体时,发现有的文章并没有标明使用的哪个抗体;或者所查文献标注使用了另一参考文献的抗体,你又进一步查阅——找了半天,却发现最初的那个作者并没有标明到底用了具体哪个抗体。所以有的参考文献的缺点就是没有抗体的具体信息。
在这种背景下,我们需要选择性地参考参考文献。一个简单粗暴的方法,就是选择那些影响因子比较高的文章,比如大于5分,可以在一定程度上保证当你Follow别人的实验步骤时,有更大的可能重复出来;也可以选择那些标注了抗体货号、稀释比例和生产厂家的文章,减少反复试验各种抗体的时间。
2、用生产商的网站:有些公司号称生产商,但是却只生产极少量的抗体,绝大部分抗体是从其他公司OEM过来的,因此质量参差不齐。有些公司不告诉客户怎么验证抗体,而让用户自己去检测。有些公司虽然秀了数据,但是这些数据却非常有限,仅仅是告诉你这个抗体可以用于何种应用,并没有说明到底检测的是什么?是否有交叉反应?往往我们抱怨比较多的是这些公司不提供完整的验证抗体的数据,批次质量不稳定。
作为研究人员,一定要选择重视抗体质量的真正的生产商。CST一直以为科研人员提供最高质量的抗体作为使命,在生产过程中非常重视抗体特异性、灵敏度、批次间一致性的检测,并将验证数据公布在网站上,对于大家选择抗体非常有帮助。有些未公布的验证失败的数据,如果研究人员问询,CST的研发科学家都非常乐意分享。这就是为什么CST能够屡次获得“最佳抗体”、“最有用的网站”、“最佳客户服务”、“研究者的首选抗体”、“五个第一”等殊荣的原因。
选择一个靠谱的厂家至关重要,其实从厂家所提供的产品说明书的详细程度就可以来判断这个厂家是不是可靠,详细并不是说篇幅越长越好,而是看实验种类是不是经过验证,有没有提供实验所需要的详细试剂。CST所有的抗体都是经过严格筛选和验证的,实验步骤都是经过优化的,我们希望客户通过网站就可以发现更多产品的相关信息,而且我们花费了很多时间来优化实验方法,比如在WB一抗稀释液这一步,到底是用脱脂奶粉稀释还是BSA稀释,可以看说明书下方的红色方框,可能有时候差异不是很大,但很多时候差异还是很明显的;在说明书右方也会提到具体的稀释比例以及稀释buffer,比如IHC到底是用柠檬酸盐修复还是EDTA修复,在说明书上都可以看到,同时我们也有很多小册子,像WB成功实验指南,IHC实验成功指南等等,而且还会检测每一个批号,确保新的批号和旧的批号是一样的实验结果,对抗体的灵敏度、 特异性、反应性、稳定性方面都会做相关的测试。
3、经销商:当今科研市场,供应商的竞争十分激烈,非正规的供应商如果想走出一条活路,即使它没有任何生产商的授权,也会转卖很多公司的产品。有的供应商缺乏专业的技术人员,对产品本身不了解,不能给客户做出专业的正确的推荐;非正规的供应商经常从大的供应商那里买来抗体,分装后重新贴上标签进行销售;有的供应商甚至直接出售假货、以次充好,把产品拿过来分装然后贴上知名产品的标签。因为整个市场不透明,导致用户所看到的产品信息,并不等同于生产商所提供的信息,最终导致科研人员买到质量很差的产品甚至假货。
作为研究人员,一定要擦亮眼睛,尽可能从生产商授权的代理商处购买。授权代理商可以从生产商的网站上查询得到,也可以直接打电话给生产商询问。询问实验室的老师和管理人员,寻找长期合作的可靠的代理商。点击此处查看CST 授权代理商。
4、第三方产品平台网站,比如CiteAb, Biocompare等,其实很多产品都是不断更新的。排名最靠前,引用文献最多的并不一定是这个供应商最好的产品,而仅仅是生产最久的产品。
因此,除了看引用文献最多的产品,还可以在平台通过关键词搜索,查看符合条件的多个产品,结合生产商网站上提供的验证数据等进行综合考量。就抗体而言,实验多检测来自于人、小鼠、大鼠的样本,作为来自于更远源种属的兔单抗,其特异性和灵敏度更好,可优先选择。
5、同行审阅。往往发表文章的时候,不需要提供详细的操作方法及全部的验证数据。可能有些已发表的实验结果并没有做3-5次的重复试验,或者做了之后只是挑选了一幅满意的图片。
如果同行审阅们有更加严格的评审标准,比如让用户尽可能的提供详细的产品货号、稀释比例及试验步骤,或者有一个专门的网页来上传所有的原始图片(用户可以参考各出版社的网站,排版说明都有不同的要求,有些杂志还会有专门的网页来存放这些图片)供他人参考,不仅会促使整个学术界形成一种好的风气,也会减少实验不可重复、造假等问题。
CST作为世界领先的抗体生产商,我们会一如既往地重视出厂前的抗体验证,即特异性、灵敏度、批次间一次性的检验,研发生产抗体的科学家为大家提供最专业的技术支持,网站提供海量的验证数据和信号通路、Phosphosite蛋白修饰数据库等学术资源,为实验的重复性贡献我们的专业力量。我们的口号是“不要让抗体成为您实验的变量”,让多方努力,共同提高整个试剂行业的可重复性。
除了上述这几个宏观方面,实验重复性差还有其他方面的原因。如研究人员没有严格遵循生产商的操作步骤,或者随意改变实验系统,使实验变量增加。因此说,除了要有质量非常可靠的抗体,还需遵循生产商的操作步骤,选择合适的模型,客户的真实反馈等其他方面也同等重要,后续请继续关注我们的文章,看看如何从微观方面来提高实验的可重复性。
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